eye+illuminator
@荣狮2190：高通量测序 Illumina HiSeq 2000 和Roche454 两种平台的区别 -
荣袁15742419859…… 这两个测序平台的区别可以参考http://www.majorbio.com/Platform/Roche454 一般做mRNA高通量测序,主要目的是要得到特定条件下的基因表达的差异,所以要有一个标准样品做对照.比如正常生长的细胞和药物处理之后的细胞样本抽提mRNA然后建库测序.如果样本中的结缔组织不是研究对象且无法去除,那么设置对照样本的时候也要选取同样的部位的组织样本.
@荣狮2190：illumina 有哪些测序仪 -
荣袁15742419859…… Illumina的测序仪是以flowcell进行测序的,一般的一张flowcell是一个run,像Hiseq2500的话是2张flowcell,也就是一次运行的测序量.每张flowcell上通常都有多个通道,每个通道可以单独测不同的样品,这样的通道就是lane.Hiseq2500的一张flowcell有8条通道,也就是8个lane. 如果上机前使用cbot的话可以每条lane都跑不同的样品,互不干扰,如果直接上机进行快速模式的话就无法区分不同样本了.
@荣狮2190：illumina测序为什么要消化第二链 -
荣袁15742419859…… illumina测序现主要是两端测序,其测序策略为测DNA一条链的前100bp,然后再测两一条链的另一端的100bp,所以在illumina测时候是一条链一条链的测序的.这也是为什么后面要消化掉第二条链的原因.
@荣狮2190：为什么 Illumina 最新测序仪能将全基因组测序价格降至 1000 美元 -
荣袁15742419859…… 最主要的是技术的更新,另外还有一部分是市场的占有策略. 1,测序技术的改进:全基因组主要应用的是illumina的Hiseq X10的测序平台,该平台在图片信息处理和flowcell上都有很大的改进(原来是平板上长簇,现在上面有小孔),另外在扩增的技术上也有一点改进(RPA扩增技术).以上几点使得数据的通量大大调高.所以相应的测序价格也会降低. 2,市场占有策略:这一点我个人理解比技术更新更重要,illumina的战略思路,占有测序市场.其实illumina的Hiseq X10的测序平台试剂要比其他平台的试剂便宜很多.不过这个平台签有协议,只能做人的全基因组重测序项目.
@荣狮2190：Illumina adaptor是如何连接在片段上的呢?连在5'端还是3'端,还是两端都连? - 作业帮
荣袁15742419859…… [答案] illumina 的接头是两头都接上,illumina测序中有成簇这一步,需要两头接头 不过illumina测序分为单端和双端,单端的话虽然接了两个接头,但是只有一个接头有测序引物.双端测序双端都有测序引物.
@荣狮2190：如何看懂illumina的检测甲基化的探针的信息 -
荣袁15742419859…… 任务占坑
@荣狮2190：illumina测序为什么要pcr扩增 -
荣袁15742419859…… 可能是你的pcr比较短,一个测序反应就可以了,同时你没有要求测通,因为由于测序原理的原因,从测序引物开始的前几十个碱基是不准或者测不到的,所以如果想知道一个pcr的全部序列就需要一对引物进行双向测序,另一条引物可以是你的扩增引物也可是根据已测序列设计的反向引物.
@荣狮2190：第二代基因测序技术的流程分别是什么,四种,Roche 454测序技术,Illumina Solexa测序技术,ABI SOLiD测序 -
荣袁15742419859…… 454测序:DNA文库制备→emPCR→上机测序 Solexa测序:文库制备→Cluster扩增→边合成边测序 SOLiD测序:样品制备→Emulsion PCR和底物准备→测序反应→图像收集→数据分析
@荣狮2190：illumina测序技术术语 lane和run是什么意思? -
荣袁15742419859…… lane表示测序芯片上的一条流通槽,测序文库与试剂均在里面,测序信号的扫描也是按照一条lane上的一个tile进行. run翻译成中文是运行的意思,这里也是这个意思,就是机器运行一次的意思.
@荣狮2190：鸡+眼+尺子+苹果+蛋糕+蛋+猴的英语是: -
荣袁15742419859…… 鸡:chicken. cock, roster(饿饿饿,反正念起来是这样,忘了怎么拼了) 眼:eye 尺子:ruler 苹果:apple 蛋糕:cake 蛋:egg 猴:monkey
荣袁15742419859…… 这两个测序平台的区别可以参考http://www.majorbio.com/Platform/Roche454 一般做mRNA高通量测序,主要目的是要得到特定条件下的基因表达的差异,所以要有一个标准样品做对照.比如正常生长的细胞和药物处理之后的细胞样本抽提mRNA然后建库测序.如果样本中的结缔组织不是研究对象且无法去除,那么设置对照样本的时候也要选取同样的部位的组织样本.
@荣狮2190：illumina 有哪些测序仪 -
荣袁15742419859…… Illumina的测序仪是以flowcell进行测序的,一般的一张flowcell是一个run,像Hiseq2500的话是2张flowcell,也就是一次运行的测序量.每张flowcell上通常都有多个通道,每个通道可以单独测不同的样品,这样的通道就是lane.Hiseq2500的一张flowcell有8条通道,也就是8个lane. 如果上机前使用cbot的话可以每条lane都跑不同的样品,互不干扰,如果直接上机进行快速模式的话就无法区分不同样本了.
@荣狮2190：illumina测序为什么要消化第二链 -
荣袁15742419859…… illumina测序现主要是两端测序,其测序策略为测DNA一条链的前100bp,然后再测两一条链的另一端的100bp,所以在illumina测时候是一条链一条链的测序的.这也是为什么后面要消化掉第二条链的原因.
@荣狮2190：为什么 Illumina 最新测序仪能将全基因组测序价格降至 1000 美元 -
荣袁15742419859…… 最主要的是技术的更新,另外还有一部分是市场的占有策略. 1,测序技术的改进:全基因组主要应用的是illumina的Hiseq X10的测序平台,该平台在图片信息处理和flowcell上都有很大的改进(原来是平板上长簇,现在上面有小孔),另外在扩增的技术上也有一点改进(RPA扩增技术).以上几点使得数据的通量大大调高.所以相应的测序价格也会降低. 2,市场占有策略:这一点我个人理解比技术更新更重要,illumina的战略思路,占有测序市场.其实illumina的Hiseq X10的测序平台试剂要比其他平台的试剂便宜很多.不过这个平台签有协议,只能做人的全基因组重测序项目.
@荣狮2190：Illumina adaptor是如何连接在片段上的呢?连在5'端还是3'端,还是两端都连? - 作业帮
荣袁15742419859…… [答案] illumina 的接头是两头都接上,illumina测序中有成簇这一步,需要两头接头 不过illumina测序分为单端和双端,单端的话虽然接了两个接头,但是只有一个接头有测序引物.双端测序双端都有测序引物.
@荣狮2190：如何看懂illumina的检测甲基化的探针的信息 -
荣袁15742419859…… 任务占坑
@荣狮2190：illumina测序为什么要pcr扩增 -
荣袁15742419859…… 可能是你的pcr比较短,一个测序反应就可以了,同时你没有要求测通,因为由于测序原理的原因,从测序引物开始的前几十个碱基是不准或者测不到的,所以如果想知道一个pcr的全部序列就需要一对引物进行双向测序,另一条引物可以是你的扩增引物也可是根据已测序列设计的反向引物.
@荣狮2190：第二代基因测序技术的流程分别是什么,四种,Roche 454测序技术,Illumina Solexa测序技术,ABI SOLiD测序 -
荣袁15742419859…… 454测序:DNA文库制备→emPCR→上机测序 Solexa测序:文库制备→Cluster扩增→边合成边测序 SOLiD测序:样品制备→Emulsion PCR和底物准备→测序反应→图像收集→数据分析
@荣狮2190：illumina测序技术术语 lane和run是什么意思? -
荣袁15742419859…… lane表示测序芯片上的一条流通槽,测序文库与试剂均在里面,测序信号的扫描也是按照一条lane上的一个tile进行. run翻译成中文是运行的意思,这里也是这个意思,就是机器运行一次的意思.
@荣狮2190：鸡+眼+尺子+苹果+蛋糕+蛋+猴的英语是: -
荣袁15742419859…… 鸡:chicken. cock, roster(饿饿饿,反正念起来是这样,忘了怎么拼了) 眼:eye 尺子:ruler 苹果:apple 蛋糕:cake 蛋:egg 猴:monkey
