illumina+hiseq
@阎吕2725：高通量测序 Illumina HiSeq 2000 和Roche454 两种平台的区别 -
糜南19636133308…… 这两个测序平台的区别可以参考http://www.majorbio.com/Platform/Roche454 一般做mRNA高通量测序,主要目的是要得到特定条件下的基因表达的差异,所以要有一个标准样品做对照.比如正常生长的细胞和药物处理之后的细胞样本抽提mRNA然后建库测序.如果样本中的结缔组织不是研究对象且无法去除,那么设置对照样本的时候也要选取同样的部位的组织样本.
@阎吕2725：illumina 有哪些测序仪 -
糜南19636133308…… Illumina的测序仪是以flowcell进行测序的,一般的一张flowcell是一个run,像Hiseq2500的话是2张flowcell,也就是一次运行的测序量.每张flowcell上通常都有多个通道,每个通道可以单独测不同的样品,这样的通道就是lane.Hiseq2500的一张flowcell有8条通道,也就是8个lane. 如果上机前使用cbot的话可以每条lane都跑不同的样品,互不干扰,如果直接上机进行快速模式的话就无法区分不同样本了.
@阎吕2725：illumina hiseq x ten和2000的测序数据有什么区别 -
糜南19636133308…… 不清楚这个易瑞什么来路,目前的基因检测主要有2类,一类是通过SNP位点(基本上是以SNP芯片为手段,也有针对单基因或少数几个基因位点的使用的是PCR加测序或分型的方式),还有一类是对全基因组进行测序,一般目前采用的是...
@阎吕2725：为什么 Illumina 最新测序仪能将全基因组测序价格降至 1000 美元 -
糜南19636133308…… 最主要的是技术的更新,另外还有一部分是市场的占有策略. 1,测序技术的改进:全基因组主要应用的是illumina的Hiseq X10的测序平台,该平台在图片信息处理和flowcell上都有很大的改进(原来是平板上长簇,现在上面有小孔),另外在扩增的技术上也有一点改进(RPA扩增技术).以上几点使得数据的通量大大调高.所以相应的测序价格也会降低. 2,市场占有策略:这一点我个人理解比技术更新更重要,illumina的战略思路,占有测序市场.其实illumina的Hiseq X10的测序平台试剂要比其他平台的试剂便宜很多.不过这个平台签有协议,只能做人的全基因组重测序项目.
@阎吕2725：华大基因illumina - hiseq测序结果怎么看 -
糜南19636133308…… 过长的测序周期以及上万美元的仪器成本,成了阻碍基因测序进入寻常百姓家的障碍.而运用新技术的基因测序仪大大降低了基因组测序的门槛,使得更多研究人员能够使用这项技术开发多种应用.
@阎吕2725：我现在主要想了解illumina技术平台,应该了解这个平台哪些方面的内容?在哪里可以找到相关资料?谢谢! -
糜南19636133308…… illumina主推Hiseq和Miseq平台你可以了解下这两个测序平台,相关资料的话,去百度去下吧,因为这些东西已经很多了.当然你也可以关注啊下Hiseq X 10这个专门测人的全基因组重测序的平台,(中国3家有,药明康德、诺禾致源、深圳的千年基因的分公司)
@阎吕2725：Illumina - HiSeq - 2000高通量测序结果分析 -
糜南19636133308…… raw_count应该是某个转录本/基因的测到的原始reads条数,normalized_count是经过标准化的数据量;差异分析需要统计 raw_count, FPKM值,pvalue
@阎吕2725：谁来说说Illumina 454 ABI 测序的区别 -
糜南19636133308…… 首先从原理上说,Illumina测序芯片是桥式扩增,形成“簇”,终止子法,双向测序;454是磁珠法扩增,利用聚合反应副产物PPi后续反应,得到荧光;ABI的SOLiD系统同样是磁珠法扩增,但利用的是连接反应(具体方法略显复杂). 其次从...
糜南19636133308…… 这两个测序平台的区别可以参考http://www.majorbio.com/Platform/Roche454 一般做mRNA高通量测序,主要目的是要得到特定条件下的基因表达的差异,所以要有一个标准样品做对照.比如正常生长的细胞和药物处理之后的细胞样本抽提mRNA然后建库测序.如果样本中的结缔组织不是研究对象且无法去除,那么设置对照样本的时候也要选取同样的部位的组织样本.
@阎吕2725：illumina 有哪些测序仪 -
糜南19636133308…… Illumina的测序仪是以flowcell进行测序的,一般的一张flowcell是一个run,像Hiseq2500的话是2张flowcell,也就是一次运行的测序量.每张flowcell上通常都有多个通道,每个通道可以单独测不同的样品,这样的通道就是lane.Hiseq2500的一张flowcell有8条通道,也就是8个lane. 如果上机前使用cbot的话可以每条lane都跑不同的样品,互不干扰,如果直接上机进行快速模式的话就无法区分不同样本了.
@阎吕2725：illumina hiseq x ten和2000的测序数据有什么区别 -
糜南19636133308…… 不清楚这个易瑞什么来路,目前的基因检测主要有2类,一类是通过SNP位点(基本上是以SNP芯片为手段,也有针对单基因或少数几个基因位点的使用的是PCR加测序或分型的方式),还有一类是对全基因组进行测序,一般目前采用的是...
@阎吕2725：为什么 Illumina 最新测序仪能将全基因组测序价格降至 1000 美元 -
糜南19636133308…… 最主要的是技术的更新,另外还有一部分是市场的占有策略. 1,测序技术的改进:全基因组主要应用的是illumina的Hiseq X10的测序平台,该平台在图片信息处理和flowcell上都有很大的改进(原来是平板上长簇,现在上面有小孔),另外在扩增的技术上也有一点改进(RPA扩增技术).以上几点使得数据的通量大大调高.所以相应的测序价格也会降低. 2,市场占有策略:这一点我个人理解比技术更新更重要,illumina的战略思路,占有测序市场.其实illumina的Hiseq X10的测序平台试剂要比其他平台的试剂便宜很多.不过这个平台签有协议,只能做人的全基因组重测序项目.
@阎吕2725：华大基因illumina - hiseq测序结果怎么看 -
糜南19636133308…… 过长的测序周期以及上万美元的仪器成本,成了阻碍基因测序进入寻常百姓家的障碍.而运用新技术的基因测序仪大大降低了基因组测序的门槛,使得更多研究人员能够使用这项技术开发多种应用.
@阎吕2725：我现在主要想了解illumina技术平台,应该了解这个平台哪些方面的内容?在哪里可以找到相关资料?谢谢! -
糜南19636133308…… illumina主推Hiseq和Miseq平台你可以了解下这两个测序平台,相关资料的话,去百度去下吧,因为这些东西已经很多了.当然你也可以关注啊下Hiseq X 10这个专门测人的全基因组重测序的平台,(中国3家有,药明康德、诺禾致源、深圳的千年基因的分公司)
@阎吕2725：Illumina - HiSeq - 2000高通量测序结果分析 -
糜南19636133308…… raw_count应该是某个转录本/基因的测到的原始reads条数,normalized_count是经过标准化的数据量;差异分析需要统计 raw_count, FPKM值,pvalue
@阎吕2725：谁来说说Illumina 454 ABI 测序的区别 -
糜南19636133308…… 首先从原理上说,Illumina测序芯片是桥式扩增,形成“簇”,终止子法,双向测序;454是磁珠法扩增,利用聚合反应副产物PPi后续反应,得到荧光;ABI的SOLiD系统同样是磁珠法扩增,但利用的是连接反应(具体方法略显复杂). 其次从...
