pdb数据库官网
@商慧3946：PDB数据库网址是什么? -
白腾15952049513…… http://www.uniprot.org/ 新的“联合蛋白质数据库”预计在三年内建成,美国国家卫生研究所已决定为这项计划斥资1500万美元.这一全球性数据库有望在2003年年底初步在因特网上开放,各国研究人 员可通过访问其网址www.uniprot.org,免费...
@商慧3946：蛋白序列、结构数据库常用的有哪些? -
白腾15952049513…… 蛋白质数据库介绍 蛋白质数据库 1. PIR和PSDPIR国际蛋白质序列数据库(PSD)是由蛋白质信息资源(PIR)、慕尼黑蛋白质序列信息中心(MIPS)和日本国际蛋白质序列数据库(JIPID)共同维护的国际上最大的公共蛋白质序列数据库.这是...
@商慧3946：pdb的数据 -
白腾15952049513…… 蛋白质数据库(Protein Data Bank,PDB) 是一个生物大分子(如蛋白质和核酸)数据库, 内容包括由全世界生物学家和生物化学家上传的蛋白质或核酸的X光晶体衍射或者NMR核磁共振结构数据,这些数据可以通过PBD的会员组织(PDBe,...
@商慧3946：pdb数据库(关于pdb数据库的基本详情介绍)
白腾15952049513…… 1、蛋白质结构数据库(Protein Data Bank,简称PDB)是美国纽约Brookhaven国家实验室于1971年创建的.2、为适应结构基因组和生物信息学研究的需要,1998年10...
@商慧3946：在pdb 数据库上下载蛋白质 -
白腾15952049513…… 你直接在PBD主页上的pbd ID or text 里输入你的蛋白ID,也就是1SA1和1SA0,就能查到你要的蛋白质了.蛋白ID旁边有个Download Files,点击后选择你要下载的文件格式即可下载.
@商慧3946：如何知道一条蛋白质序列在PBD数据库中有没有3D结构? -
白腾15952049513…… 1.在NCBI或者BLAST中找到这段序列所在蛋白质的名称,以及其它所有用过的名字或者别名 2.在PDB中搜索这些名字或名称,看有没有存在的结晶结构, 大多数是NMR的或者X-ray的. 3.不放心的话,可以在string啦,或者其他的数据库中找相关的链接,看看有没有PDB的相关标号,就是4位由数字和字母混合成的晶体结构标号. 4.几方面一综合,就知道有没有了.不过如果不是关键蛋白质的话不要抱太大的希望,结晶难度很大,所以存在的晶体结构不是很多的,没有晶体结构的3D结构都是预测或者推测的,不作数. 以上
@商慧3946：我想从蛋白质的pdb文件中批量提取出序列的信息,怎么搞 -
白腾15952049513…… 你是想把蛋白的序列提取出来是吗,可以用perl写个脚本,先一个一个的打开pdb文件,然后读出以SEQRES开头的行,并写入到一个新的文件中.
@商慧3946：在.net项目中生成的pdb是什么文件? -
白腾15952049513…… 在.net项目中生成的pdb是程序数据库文件. PDB文件是Palm OS操作系统上数据文件类型.一般我们在使用Palm系统的电子书时都会遇到这种文件,一般用于电子书或手机电子书 pdb是Palm DataBase的缩写,Palm OS所用文件的扩展名为“....
@商慧3946：pdb数据库怎么转换到SQL2005 -
白腾15952049513…… 1.(确保PDM没有语法问题的前提下 Check Model)对准PDM的 Diagram 右键 Properties >> Preview 里面你看到的就是指定类型的SQL语句了. 2.把SQL语句复制出来(或按组合键 Ctrl + G :将脚本生成单独的脚本文件)3.组合键Ctrl + Shift ...
白腾15952049513…… http://www.uniprot.org/ 新的“联合蛋白质数据库”预计在三年内建成,美国国家卫生研究所已决定为这项计划斥资1500万美元.这一全球性数据库有望在2003年年底初步在因特网上开放,各国研究人 员可通过访问其网址www.uniprot.org,免费...
@商慧3946：蛋白序列、结构数据库常用的有哪些? -
白腾15952049513…… 蛋白质数据库介绍 蛋白质数据库 1. PIR和PSDPIR国际蛋白质序列数据库(PSD)是由蛋白质信息资源(PIR)、慕尼黑蛋白质序列信息中心(MIPS)和日本国际蛋白质序列数据库(JIPID)共同维护的国际上最大的公共蛋白质序列数据库.这是...
@商慧3946：pdb的数据 -
白腾15952049513…… 蛋白质数据库(Protein Data Bank,PDB) 是一个生物大分子(如蛋白质和核酸)数据库, 内容包括由全世界生物学家和生物化学家上传的蛋白质或核酸的X光晶体衍射或者NMR核磁共振结构数据,这些数据可以通过PBD的会员组织(PDBe,...
@商慧3946：pdb数据库(关于pdb数据库的基本详情介绍)
白腾15952049513…… 1、蛋白质结构数据库(Protein Data Bank,简称PDB)是美国纽约Brookhaven国家实验室于1971年创建的.2、为适应结构基因组和生物信息学研究的需要,1998年10...
@商慧3946：在pdb 数据库上下载蛋白质 -
白腾15952049513…… 你直接在PBD主页上的pbd ID or text 里输入你的蛋白ID,也就是1SA1和1SA0,就能查到你要的蛋白质了.蛋白ID旁边有个Download Files,点击后选择你要下载的文件格式即可下载.
@商慧3946：如何知道一条蛋白质序列在PBD数据库中有没有3D结构? -
白腾15952049513…… 1.在NCBI或者BLAST中找到这段序列所在蛋白质的名称,以及其它所有用过的名字或者别名 2.在PDB中搜索这些名字或名称,看有没有存在的结晶结构, 大多数是NMR的或者X-ray的. 3.不放心的话,可以在string啦,或者其他的数据库中找相关的链接,看看有没有PDB的相关标号,就是4位由数字和字母混合成的晶体结构标号. 4.几方面一综合,就知道有没有了.不过如果不是关键蛋白质的话不要抱太大的希望,结晶难度很大,所以存在的晶体结构不是很多的,没有晶体结构的3D结构都是预测或者推测的,不作数. 以上
@商慧3946：我想从蛋白质的pdb文件中批量提取出序列的信息,怎么搞 -
白腾15952049513…… 你是想把蛋白的序列提取出来是吗,可以用perl写个脚本,先一个一个的打开pdb文件,然后读出以SEQRES开头的行,并写入到一个新的文件中.
@商慧3946：在.net项目中生成的pdb是什么文件? -
白腾15952049513…… 在.net项目中生成的pdb是程序数据库文件. PDB文件是Palm OS操作系统上数据文件类型.一般我们在使用Palm系统的电子书时都会遇到这种文件,一般用于电子书或手机电子书 pdb是Palm DataBase的缩写,Palm OS所用文件的扩展名为“....
@商慧3946：pdb数据库怎么转换到SQL2005 -
白腾15952049513…… 1.(确保PDM没有语法问题的前提下 Check Model)对准PDM的 Diagram 右键 Properties >> Preview 里面你看到的就是指定类型的SQL语句了. 2.把SQL语句复制出来(或按组合键 Ctrl + G :将脚本生成单独的脚本文件)3.组合键Ctrl + Shift ...
