rcsb+pdb数据库官网
@祁沈3206：PDB数据库网址是什么? -
哈相19346935194…… http://www.uniprot.org/ 新的“联合蛋白质数据库”预计在三年内建成,美国国家卫生研究所已决定为这项计划斥资1500万美元.这一全球性数据库有望在2003年年底初步在因特网上开放,各国研究人 员可通过访问其网址www.uniprot.org,免费...
@祁沈3206：蛋白序列、结构数据库常用的有哪些? -
哈相19346935194…… 蛋白质数据库介绍 蛋白质数据库 1. PIR和PSDPIR国际蛋白质序列数据库(PSD)是由蛋白质信息资源(PIR)、慕尼黑蛋白质序列信息中心(MIPS)和日本国际蛋白质序列数据库(JIPID)共同维护的国际上最大的公共蛋白质序列数据库.这是...
@祁沈3206：pdb的数据 -
哈相19346935194…… 蛋白质数据库(Protein Data Bank,PDB) 是一个生物大分子(如蛋白质和核酸)数据库, 内容包括由全世界生物学家和生物化学家上传的蛋白质或核酸的X光晶体衍射或者NMR核磁共振结构数据,这些数据可以通过PBD的会员组织(PDBe,...
@祁沈3206：pdb数据库(关于pdb数据库的基本详情介绍)
哈相19346935194…… 1、蛋白质结构数据库(Protein Data Bank,简称PDB)是美国纽约Brookhaven国家实验室于1971年创建的.2、为适应结构基因组和生物信息学研究的需要,1998年10...
@祁沈3206：在pdb 数据库上下载蛋白质 -
哈相19346935194…… 你直接在PBD主页上的pbd ID or text 里输入你的蛋白ID,也就是1SA1和1SA0,就能查到你要的蛋白质了.蛋白ID旁边有个Download Files,点击后选择你要下载的文件格式即可下载.
@祁沈3206：怎样通过PDB网站查询蛋白质的结构,并绘图作出其活性中心,二维结构等相关信息 -
哈相19346935194…… PDB网站的查询方式其实很简答,可是输入ID,也可以直接输入你要查找的蛋白的英文名字,数据库提供的都是已经解析的蛋白,因此,里面会有详细的介绍该蛋白的各个特征,包含结构,活性中心以及底物等.结构分析软件很多,pymol是其中一种,也可以用spdviewer,chimera等等.都可以做出漂亮的图.
@祁沈3206：我想从蛋白质的pdb文件中批量提取出序列的信息,怎么搞 -
哈相19346935194…… 你是想把蛋白的序列提取出来是吗,可以用perl写个脚本,先一个一个的打开pdb文件,然后读出以SEQRES开头的行,并写入到一个新的文件中.
@祁沈3206：oracle cdb能改为pdb吗 -
哈相19346935194…… 不可以改,CDB和PDB是两个不同概念的数据库,负责的工作也不一样,CDB数据库可以包含多个PDB,CDB与PDB之间的关系类似于SQL SERVER的单实例多数据库架构. CDB(Container Database):数据库容器 PDB(Pluggable Database):可插拔数据库
@祁沈3206：怎样从pdb数据库获取rna三级结构 -
哈相19346935194…… 一个长度为n的RNA序列R=r1r2…rn 的假 结结构定义为碱基配对集合S={(ri,rj )},其中 (ri,rj)满足以下条件: (1)(ri,rj)∈{(A,U),(U,A),(G,C), (C,G),(G,U),(U,G)},1≤i 3; (2)若(ri,rj)∈S,(rk,rg)∈S,则i =k当且 仅当j =g; (3)愁(ri1,rj1),(ri2,rj2),…,(...
@祁沈3206：请问PDB怎么搜索相关的蛋白 -
哈相19346935194…… 在ncbi 的search搜索框上面有下拉框选项,里面可以选基因序列(nucleotide)或者蛋白质序列(protein)
哈相19346935194…… http://www.uniprot.org/ 新的“联合蛋白质数据库”预计在三年内建成,美国国家卫生研究所已决定为这项计划斥资1500万美元.这一全球性数据库有望在2003年年底初步在因特网上开放,各国研究人 员可通过访问其网址www.uniprot.org,免费...
@祁沈3206：蛋白序列、结构数据库常用的有哪些? -
哈相19346935194…… 蛋白质数据库介绍 蛋白质数据库 1. PIR和PSDPIR国际蛋白质序列数据库(PSD)是由蛋白质信息资源(PIR)、慕尼黑蛋白质序列信息中心(MIPS)和日本国际蛋白质序列数据库(JIPID)共同维护的国际上最大的公共蛋白质序列数据库.这是...
@祁沈3206：pdb的数据 -
哈相19346935194…… 蛋白质数据库(Protein Data Bank,PDB) 是一个生物大分子(如蛋白质和核酸)数据库, 内容包括由全世界生物学家和生物化学家上传的蛋白质或核酸的X光晶体衍射或者NMR核磁共振结构数据,这些数据可以通过PBD的会员组织(PDBe,...
@祁沈3206：pdb数据库(关于pdb数据库的基本详情介绍)
哈相19346935194…… 1、蛋白质结构数据库(Protein Data Bank,简称PDB)是美国纽约Brookhaven国家实验室于1971年创建的.2、为适应结构基因组和生物信息学研究的需要,1998年10...
@祁沈3206：在pdb 数据库上下载蛋白质 -
哈相19346935194…… 你直接在PBD主页上的pbd ID or text 里输入你的蛋白ID,也就是1SA1和1SA0,就能查到你要的蛋白质了.蛋白ID旁边有个Download Files,点击后选择你要下载的文件格式即可下载.
@祁沈3206：怎样通过PDB网站查询蛋白质的结构,并绘图作出其活性中心,二维结构等相关信息 -
哈相19346935194…… PDB网站的查询方式其实很简答,可是输入ID,也可以直接输入你要查找的蛋白的英文名字,数据库提供的都是已经解析的蛋白,因此,里面会有详细的介绍该蛋白的各个特征,包含结构,活性中心以及底物等.结构分析软件很多,pymol是其中一种,也可以用spdviewer,chimera等等.都可以做出漂亮的图.
@祁沈3206：我想从蛋白质的pdb文件中批量提取出序列的信息,怎么搞 -
哈相19346935194…… 你是想把蛋白的序列提取出来是吗,可以用perl写个脚本,先一个一个的打开pdb文件,然后读出以SEQRES开头的行,并写入到一个新的文件中.
@祁沈3206：oracle cdb能改为pdb吗 -
哈相19346935194…… 不可以改,CDB和PDB是两个不同概念的数据库,负责的工作也不一样,CDB数据库可以包含多个PDB,CDB与PDB之间的关系类似于SQL SERVER的单实例多数据库架构. CDB(Container Database):数据库容器 PDB(Pluggable Database):可插拔数据库
@祁沈3206：怎样从pdb数据库获取rna三级结构 -
哈相19346935194…… 一个长度为n的RNA序列R=r1r2…rn 的假 结结构定义为碱基配对集合S={(ri,rj )},其中 (ri,rj)满足以下条件: (1)(ri,rj)∈{(A,U),(U,A),(G,C), (C,G),(G,U),(U,G)},1≤i 3; (2)若(ri,rj)∈S,(rk,rg)∈S,则i =k当且 仅当j =g; (3)愁(ri1,rj1),(ri2,rj2),…,(...
@祁沈3206：请问PDB怎么搜索相关的蛋白 -
哈相19346935194…… 在ncbi 的search搜索框上面有下拉框选项,里面可以选基因序列(nucleotide)或者蛋白质序列(protein)
