rna二级结构预测
@吴志436：如何使用Mfold软件?预测RNA的二级结构? -
卞琛19857287572…… 预测RNA二级结构如下进行:1. 选择file|RNA fold single strand启动模块,单击sequence按键,打开对话框以载入序列,此序列必需以.SEQ为扩展文件名,其它序列文件可在序列编辑器中转为此格式.注意必需为大写字母.2. 输入文件名后,缺...
@吴志436：如何预测lncrna的二级结构 -
卞琛19857287572…… 个人觉得lncrna更有研究前景,mirna序列段作用单一(通过序列互补靶向靶基因降解或者抑制靶基因)各种mirna数据库以及针对mirna靶基因预测以及数据库甚至高通量实验都已经非常完善.但是lncrna是刚处于研究的起始阶段,其功能机制都不太明确,现有研究只能说明lncrna具有多种功能,因此如果你做lncrna可做的东西非常多,加上lncrna功能复杂因此更具有研究前景.
@吴志436：如何读懂rnafold的参数设置 -
卞琛19857287572…… 预测RNA二级结构如下进行:1. 选择file|RNA fold single strand启动模块,单击sequence按键,打开对话框以载入序列,此序列必需以.SEQ为扩展文件名,其它序列文件可在序列编辑器中转为此格式.注意必需为大写字母. 2. 输入文件名后,...
@吴志436：RNA二级结构的特点是什么 -
卞琛19857287572…… RNA的二级结构为三叶草结构,其结构特征为: (1)tRNA的二级结构由四臂、四环组成,已配对的片断称为臂,未配对的片断称为环. (2)叶柄是氨基酸臂,其上含有CCA-OH3',此结构是接受氨基酸的位置. (3)氨基酸臂对面是反密码子环...
@吴志436：已知RNA的二级结构,用哪个软件可以测得它的自由能 -
卞琛19857287572…… RNAstructure可以,把自由能差别那项调大一点就可以了.RNAstructure网上有免费下的.
@吴志436：关于RNA二级结构预测——sfold法一系列问题 -
卞琛19857287572…… 1 什么软件可以预测RNA二级结构:在线的有:mfold http://mfold.rna.albany.edu/?q=mfold RNAfold http://rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAfold.cgi 还有你老师指定的SFold http://sfold.wadsworth.org/cgi-bin/index.pl 教程什么的你上网页看看,自己随...
@吴志436：什么是RNA二级结构?什么是RNA的二级结构?用什么算法可以比较RNA二级结构的相似性? - 作业帮
卞琛19857287572…… [答案] RNA分子中有以氢键联接碱基(A对U;G对C)形成的二级结构.
@吴志436：obseved secondary structure 什么意思?它和predicted secondary structure有什么区别? -
卞琛19857287572…… predicted secondary structure:(软件或网站)预测的(蛋白、RNA,DNA)二级结构;observed secondary structure:是经过实验证明了的二级结构.二者一般放在一起进行比较,也就是说,预测出来的二级结构要经过实验的验证才能证实该结构是正确的或者是合理的.
@吴志436：求助预测RNA二级结构的软件,适合win7 -
卞琛19857287572…… MATLAB中的工具箱有rnafold(s)是较好的预测软件,还有pknotsRG软件,我现在win7下一直在用的预测RNA假结结构的软件,可以预测长序列!
卞琛19857287572…… 预测RNA二级结构如下进行:1. 选择file|RNA fold single strand启动模块,单击sequence按键,打开对话框以载入序列,此序列必需以.SEQ为扩展文件名,其它序列文件可在序列编辑器中转为此格式.注意必需为大写字母.2. 输入文件名后,缺...
@吴志436：如何预测lncrna的二级结构 -
卞琛19857287572…… 个人觉得lncrna更有研究前景,mirna序列段作用单一(通过序列互补靶向靶基因降解或者抑制靶基因)各种mirna数据库以及针对mirna靶基因预测以及数据库甚至高通量实验都已经非常完善.但是lncrna是刚处于研究的起始阶段,其功能机制都不太明确,现有研究只能说明lncrna具有多种功能,因此如果你做lncrna可做的东西非常多,加上lncrna功能复杂因此更具有研究前景.
@吴志436：如何读懂rnafold的参数设置 -
卞琛19857287572…… 预测RNA二级结构如下进行:1. 选择file|RNA fold single strand启动模块,单击sequence按键,打开对话框以载入序列,此序列必需以.SEQ为扩展文件名,其它序列文件可在序列编辑器中转为此格式.注意必需为大写字母. 2. 输入文件名后,...
@吴志436：RNA二级结构的特点是什么 -
卞琛19857287572…… RNA的二级结构为三叶草结构,其结构特征为: (1)tRNA的二级结构由四臂、四环组成,已配对的片断称为臂,未配对的片断称为环. (2)叶柄是氨基酸臂,其上含有CCA-OH3',此结构是接受氨基酸的位置. (3)氨基酸臂对面是反密码子环...
@吴志436：已知RNA的二级结构,用哪个软件可以测得它的自由能 -
卞琛19857287572…… RNAstructure可以,把自由能差别那项调大一点就可以了.RNAstructure网上有免费下的.
@吴志436：关于RNA二级结构预测——sfold法一系列问题 -
卞琛19857287572…… 1 什么软件可以预测RNA二级结构:在线的有:mfold http://mfold.rna.albany.edu/?q=mfold RNAfold http://rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAfold.cgi 还有你老师指定的SFold http://sfold.wadsworth.org/cgi-bin/index.pl 教程什么的你上网页看看,自己随...
@吴志436：什么是RNA二级结构?什么是RNA的二级结构?用什么算法可以比较RNA二级结构的相似性? - 作业帮
卞琛19857287572…… [答案] RNA分子中有以氢键联接碱基(A对U;G对C)形成的二级结构.
@吴志436：obseved secondary structure 什么意思?它和predicted secondary structure有什么区别? -
卞琛19857287572…… predicted secondary structure:(软件或网站)预测的(蛋白、RNA,DNA)二级结构;observed secondary structure:是经过实验证明了的二级结构.二者一般放在一起进行比较,也就是说,预测出来的二级结构要经过实验的验证才能证实该结构是正确的或者是合理的.
@吴志436：求助预测RNA二级结构的软件,适合win7 -
卞琛19857287572…… MATLAB中的工具箱有rnafold(s)是较好的预测软件,还有pknotsRG软件,我现在win7下一直在用的预测RNA假结结构的软件,可以预测长序列!
