uniprot数据库基本功能介绍
@解谢275：蛋白质序列数据库的介绍 -
於莺13671266906…… 指应用计算机功能分析生物学信息的数据库.应用计算机的运算法则,比较DNA和蛋白质序列而检测结构、功能和序列之间的进化关系.各种基因组的序列产生大量的DNA序列数据和生物信息,已经被应用于研究基因的功能,预测以前未知的基因功能.现在人们的注意力主要集中在从仅有的氨基酸序列预测蛋白质结构和功能.
@解谢275：生物信息数据库分为哪四大类 -
於莺13671266906…… 按大小可以分为1.公共数据库2. 从公共数据库中取数据做进一步处理的专业数据库,提供更多的分析工具按功能分可以有基因库GENEBANK,蛋白库UNIPROT, 结构库PDB, 功能分类 GO库,通路库 KEG...
@解谢275：亲水性蛋白和疏水性蛋白都有哪些 -
於莺13671266906…… 可以从氨基酸组成上分析,比如用软件分析有多少个氨基酸组成,其中疏水性氨基酸有多少,亲水性氨基酸有多少,然后软件会综合分析出整个序列的亲疏水性.不过这个方法只是预测,未必准确.然后就是通过盐析实验来分析,具体就是通过加入不同浓度的中性盐比如硫酸铵,分级沉淀蛋白质,根据蛋白质沉淀时的盐浓度来判断亲疏水性.
@解谢275：如何在uniprot数据库中查找某个蛋白序列 -
於莺13671266906…… NCBI NCBI下有很多数据库,以下是蛋白质序列PopSet 包括研究1个人群、1个种系产生或描写人群变化的1组组联合序列.PopSet既包括核酸序列数据又包括蛋白质序列数据. Entrez 功能强大,在于它的大多数记录可相互链接,既可在同1数...
@解谢275：Swissprot数据库如何找出蛋白质的相似序列 -
於莺13671266906…… 总的而言有下列12种0 = pairwise,显示具体匹配信息(缺省)1 = query-anchored showing identities,查询-比上区域,显示一致性2 = query-anchored no identities,查询-比上区域,不显示一致性3 = flat query-anchored, show identities,查询-比...
@解谢275：说明 GenBank, RefSeq, UniProt 的异同.
於莺13671266906…… GenBank 是一个有来自于70,000多种生物的核苷酸序列的数据库.每条纪录都有编码区(CDS)特征的注释,还包括氨基酸的翻译.GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织,包括EMBL和DDBJ. 完整的GenBank数据库包括序列文件,...
@解谢275：试述SWISS - PROT中的数据来源. -
於莺13671266906…… (1)从核酸数据库经过翻译推导而来; (2)从蛋白质数据库PIR挑选出合适的数据; (3)从科学文献中摘录; (4)研究人员直接提交的蛋白质序列数据.
@解谢275：几种常用Web数据库的比较 -
於莺13671266906…… SWISSPROT的序列经过严格审核,注释完善,但数量仍较 少.PIR数据量较大,但包含未经验证的序列,注释也不完善.TrEMBL和GenPept的数据量最大,且随核酸序列数据库的 更新而更新,但是由于TrEMBL和GenPept均是由核酸序列 经过计算机程序翻译生成的,这两个数据库中的序列错误 率较大,并存在较多的冗余序列.UniProt中的序列具有较好的代表性,数据较完整.
於莺13671266906…… 指应用计算机功能分析生物学信息的数据库.应用计算机的运算法则,比较DNA和蛋白质序列而检测结构、功能和序列之间的进化关系.各种基因组的序列产生大量的DNA序列数据和生物信息,已经被应用于研究基因的功能,预测以前未知的基因功能.现在人们的注意力主要集中在从仅有的氨基酸序列预测蛋白质结构和功能.
@解谢275：生物信息数据库分为哪四大类 -
於莺13671266906…… 按大小可以分为1.公共数据库2. 从公共数据库中取数据做进一步处理的专业数据库,提供更多的分析工具按功能分可以有基因库GENEBANK,蛋白库UNIPROT, 结构库PDB, 功能分类 GO库,通路库 KEG...
@解谢275：亲水性蛋白和疏水性蛋白都有哪些 -
於莺13671266906…… 可以从氨基酸组成上分析,比如用软件分析有多少个氨基酸组成,其中疏水性氨基酸有多少,亲水性氨基酸有多少,然后软件会综合分析出整个序列的亲疏水性.不过这个方法只是预测,未必准确.然后就是通过盐析实验来分析,具体就是通过加入不同浓度的中性盐比如硫酸铵,分级沉淀蛋白质,根据蛋白质沉淀时的盐浓度来判断亲疏水性.
@解谢275：如何在uniprot数据库中查找某个蛋白序列 -
於莺13671266906…… NCBI NCBI下有很多数据库,以下是蛋白质序列PopSet 包括研究1个人群、1个种系产生或描写人群变化的1组组联合序列.PopSet既包括核酸序列数据又包括蛋白质序列数据. Entrez 功能强大,在于它的大多数记录可相互链接,既可在同1数...
@解谢275：Swissprot数据库如何找出蛋白质的相似序列 -
於莺13671266906…… 总的而言有下列12种0 = pairwise,显示具体匹配信息(缺省)1 = query-anchored showing identities,查询-比上区域,显示一致性2 = query-anchored no identities,查询-比上区域,不显示一致性3 = flat query-anchored, show identities,查询-比...
@解谢275：说明 GenBank, RefSeq, UniProt 的异同.
於莺13671266906…… GenBank 是一个有来自于70,000多种生物的核苷酸序列的数据库.每条纪录都有编码区(CDS)特征的注释,还包括氨基酸的翻译.GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织,包括EMBL和DDBJ. 完整的GenBank数据库包括序列文件,...
@解谢275：试述SWISS - PROT中的数据来源. -
於莺13671266906…… (1)从核酸数据库经过翻译推导而来; (2)从蛋白质数据库PIR挑选出合适的数据; (3)从科学文献中摘录; (4)研究人员直接提交的蛋白质序列数据.
@解谢275：几种常用Web数据库的比较 -
於莺13671266906…… SWISSPROT的序列经过严格审核,注释完善,但数量仍较 少.PIR数据量较大,但包含未经验证的序列,注释也不完善.TrEMBL和GenPept的数据量最大,且随核酸序列数据库的 更新而更新,但是由于TrEMBL和GenPept均是由核酸序列 经过计算机程序翻译生成的,这两个数据库中的序列错误 率较大,并存在较多的冗余序列.UniProt中的序列具有较好的代表性,数据较完整.
