illumina+novaseq

@卓航2150:港版美素佳儿金装的NOVAS尊属牛奶是什么,是独有的吗?和之前有什么不同? -
文戚19654626183…… NOVAS尊属牛奶是商品名称,用来描述荷兰自家农场的高品质牛奶.而升级版的港版美素佳儿金装的奶源,就是采用的荷兰自家农场NOVAS尊属牛奶,富含分子细小、结构柔软的酪蛋白,帮助宝宝消化吸收.

@卓航2150:为什么 Illumina 最新测序仪能将全基因组测序价格降至 1000 美元 -
文戚19654626183…… 最主要的是技术的更新,另外还有一部分是市场的占有策略. 1,测序技术的改进:全基因组主要应用的是illumina的Hiseq X10的测序平台,该平台在图片信息处理和flowcell上都有很大的改进(原来是平板上长簇,现在上面有小孔),另外在扩增的技术上也有一点改进(RPA扩增技术).以上几点使得数据的通量大大调高.所以相应的测序价格也会降低. 2,市场占有策略:这一点我个人理解比技术更新更重要,illumina的战略思路,占有测序市场.其实illumina的Hiseq X10的测序平台试剂要比其他平台的试剂便宜很多.不过这个平台签有协议,只能做人的全基因组重测序项目.

@卓航2150:illumina 有哪些测序仪 -
文戚19654626183…… Illumina的测序仪是以flowcell进行测序的,一般的一张flowcell是一个run,像Hiseq2500的话是2张flowcell,也就是一次运行的测序量.每张flowcell上通常都有多个通道,每个通道可以单独测不同的样品,这样的通道就是lane.Hiseq2500的一张flowcell有8条通道,也就是8个lane. 如果上机前使用cbot的话可以每条lane都跑不同的样品,互不干扰,如果直接上机进行快速模式的话就无法区分不同样本了.

@卓航2150:Illumina最新的试剂(上机测序试剂)有哪些 -
文戚19654626183…… 他们是两家不同公司的测序平台1.原理illumina的Hiseq2000和454都是通过单序列的扩增放大信号,只是Hiseq2000中间有桥式扩增,可以两头测序.测序长度来讲,Hiseq2000一般为1X100和2X100的模式,而454平均500bp左右,最长700左...

@卓航2150:第二代DNA测序技术的基本原理 -
文戚19654626183…… Illumina/Solexa Genome Analyzer测序的基本原理是边合成边测序.在Sanger等测序方法的基础上,通过技术创新,用不同颜色的荧光标记四种不同的dNTP,当DNA聚合酶合成互补链时,每添加一种dNTP就会释放出不同的荧光,根据捕捉的荧光信号并经过特定的计算机软件处理,从而获得待测DNA的序列信息.

@卓航2150:目前使用的下一代测序技术有几种 -
文戚19654626183…… 最近市面上出现了很多新一代测序仪产品,例如美国Roche AppliedScience公司的454基因组测序仪、美国Illumina公司和英国Solexatechnology公司合作开发的 Illumina测序仪、美国AppliedBiosystems公司的SOLiD测序仪、Dover/Harvard公司的Polonator测序仪以 及美国Helicos公司的HeliScope单分子测序仪.所有这些新型测序仪都使用了一种新的测序策略——循环芯片测序法(cyclic- arraysequencing),也可将其称为“新一代测序技术或者第二代测序技术

@卓航2150:高通量测序 Illumina HiSeq 2000 和Roche454 两种平台的区别 -
文戚19654626183…… 这两个测序平台的区别可以参考http://www.majorbio.com/Platform/Roche454 一般做mRNA高通量测序,主要目的是要得到特定条件下的基因表达的差异,所以要有一个标准样品做对照.比如正常生长的细胞和药物处理之后的细胞样本抽提mRNA然后建库测序.如果样本中的结缔组织不是研究对象且无法去除,那么设置对照样本的时候也要选取同样的部位的组织样本.

@卓航2150:illumina测序为什么要消化第二链 -
文戚19654626183…… illumina测序现主要是两端测序,其测序策略为测DNA一条链的前100bp,然后再测两一条链的另一端的100bp,所以在illumina测时候是一条链一条链的测序的.这也是为什么后面要消化掉第二条链的原因.

@卓航2150:如何向NCBI提交序列 -
文戚19654626183…… 1.整理序列信息:包括病原采集地、病原的寄主、寄主症状、采集人等基本信息;还有序列分析结果,包括序列全长大小,开放阅读框(ORF)的长度、位置及特定ORF序列翻译的氨基酸 序列等基因水平的信息,这对于接下来的快速准确提交序...

@卓航2150:illumina产生的reads序列特征 -
文戚19654626183…… 没看明白你overlap500是什么意思?是插入片段500吗?illumina所产生的reads分为read1和read2,不管插入片段是多少都是这样,比如说 你插入片段是180bp那么read1和read2就有20的overlap,如果是大于200这两个read就没有重叠区了.

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