actin引物序列

@钦齿2572:知道actin引物序列怎么查片段大小 -
夔品15939091781…… 进入NCBI网站,点击BLAST,输入一段引物序列,进行BLAST,会得到一些与之匹配的基因;然后再用另一段引物序列进行BLAST.比较两次结果,找到引物所匹配的基因,BLAST的时候会告诉你...

@钦齿2572:求助水稻的actin 内参基因引物 -
夔品15939091781…… 在这个专利文件里面有全长,引物你自己设计吧 http://www.google.com/patents/download/5641876_Rice_actin_gene_and_promoter.pdf?id=TEApAAAAEBAJ&output=pdf&sig=ACfU3U0XOeQP4z3gDHb20ne9M2PjiV14xg&source=gbs_overview_r&cad=0

@钦齿2572:各位:柑橘actin家族基因如何下载,我要设计actin2的引物,扩增大约1Kb 的片段.谢了! -
夔品15939091781…… 去NCBI 搜索关键词 citrus 和 Actin,如果之前有人上传了有这个属的Actin序列的话你就可以搜索的到,然后选择你要的序列,点开后再点fasta就可以下载序列了.如果不幸的没有人上传过这个属的Actin序列信息,我建议你下载一些其他属的Actin序列,然后设计通用引物.Actin家族的序列有不少相当保守的区域,设计通用引物没有任何问题,我就这么设计的通用引物从不少没有研究过的低等蕨类植物中扩增了Actin片段.

@钦齿2572:用actin基因检测反转录结果,是怎么操作?具体点,谢谢... -
夔品15939091781…… Actin是管家基因,在任何组织和任何发育阶段表达量都是恒定的,所以我们用Actin来检测反转录时RNA有没有问题,以及反转录的目的基因表达量如何.所以你要用actin的话,你需要先设计一对actin的引物,然后用actin的引物去跑RT-PCR,如果电泳Actin条带,那么你再用同样的RNA或者cDNA模板做RT-PCR,这样你的结果就是可靠的.

@钦齿2572:如何用actin基因检测反转录结果,具体点,谢谢... -
夔品15939091781…… 1.要有你的反转录产物2.要设计或者有可以pcr扩增actin基因的引物3.用一般pcr的方法,以你的反转录产物为模板,用扩增actin的引物进行pcr扩增4.扩增完之后跑电泳检测,看条带大小,最好再测序验证一下,是否为目的片段 如果扩出来了,即能证明你的反转录没有问题,可以用反转录产物做别的实验了

@钦齿2572:请问:不同物种中(如一种植物和一种动物)的同一种管家基因(如β - actin)的cDNA序列是否相同?请问:能不能直接拿一种植物的管家基因的引物序列来... - 作业帮
夔品15939091781…… [答案] 是不同的.

@钦齿2572:怎样用actin基因检测反转录结果?PCR程序.谢谢! -
夔品15939091781…… 你首先要设计actin的引物,根据引物的GC含量确定退火温度,这个在设计引物的软件上可直接给出,至于变性和延伸跟其他基因的PCR程序没啥区别.要P出来很清晰的一条带,并且和你设计的那段长度是一样的,说明反转录是成功的.

@钦齿2572:PCR没P出条带 很迷茫 -
夔品15939091781…… 情况比较复杂,你得确认1.你的RNA没问题,没有被降解,cDNA合成没问题.可以用该材料的actin引物做PCR检测试试.2你P的基因如果是已知序列,那么设计引物应该很简单,如果是未知的,那么兼并引物没P出东西来是有可能的.若是根据已知序列设计的引物而没有P出产物那就是你PCR体系或者Tm有问题了,试试TOUCHDOWN程序.若是兼并引物,采用touchdown程序,没有P出来的话,要么是引物不行,要么是你的材料取材时间不对,你要扩增的基因没有表达出来.问题比较多,一个一个排除,确保你实验的科学性.祝实验成功.

@钦齿2572:我提取出转基因小鼠的基因组后,对基因组中β - actin序列进行扩增,引物如何设计呢? -
夔品15939091781…… 在线引物设计站点http://www.bioon.com/experiment/mob/68994.shtml 请参考PCR引物设计的黄金法则http://hi.baidu.com/kingstar3w/blog/item/0278c2de9ec7185794ee3711.html

@钦齿2572:在做PCR实验时为什么总是P不出条带? -
夔品15939091781…… 普通PCR的话有很多影响因素.比如说酶,退火温度,引物设计,变性温度等很多问题.首先说你的模板是不是很复杂,需不需要加入额外的GC enhancer,或者提高预变性的温度.在者,你的退火温度是否合适,一般会选择引物Tm值-5度左右,不行的话可以做一个梯度PCR.然后不你的酶是不是合适,长片段的要长片段的酶,高保真时要保真度高的酶,而Taq酶就很容易做出来了.

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